V současnosti je známo více než 130 typů HPV. Všechny jsou označovány čísly (HPV 1, HPV 2, HPV 3 atd.). Jednotlivé typy mohou způsobit různá onemocnění v různých částech těla, převážně se jedná o onemocnění nezávažná – nejznámější jsou bradavice na ploskách nohou. Asi 26 typů HPV má vyšší přilnavost k pohlavnímu ústrojí. Tyto HPV způsobují změny téměř výhradně na pohlavních orgánech – děložním hrdle (čípku), pochvě, zevních rodidlech, penisu a řitním svěrači (anu). Celkem 12 typů je označováno jako „málo rizikové“ – LR (low risk, neonkogenní). Hlavní zástupci skupiny LR jsou HPV 6 a HPV 11. Na pohlavních orgánech způsobují především vznik nezhoubných pohlavních bradavic tzv. kondylomat. HPV skupiny LR nemají prokázanou souvislost se vznikem rakoviny. Zbylých 14 typů HPV je označováno jako „vysoce rizikové“ – HR (high risk, onkogenní). Hlavními zástupci jsou HPV 16, HPV 18, HPV 31, HPV 33, HPV 45 a HPV 52. HPV skupiny HR jsou příčinou rakoviny děložního hrdla a infekce těmito typy je rizikem pro její pozdější rozvoj. První dva typy (16 a 18) jsou nejčastější a způsobují asi 70 % ze všech případů rakoviny děložního hrdla.